I - THEMES DE RECHERCHE DÉVELOPPÉS

- Concepts d’association et d’individualité biologique en histoire des sciences; histoire de la symbiose et histoire du mutualisme. Transferts de concepts entre les sciences de la société et les sciences biologiques.

- Nouveaux modes de connaissance en sciences biologiques (auto-organisation et systèmes complexes, coopération et interdépendances dans le monde vivant); modèles contemporains du vivant. Symbiose, mutualisme et modélisation.

- Disciplines scientifiques et non-Science dans la connaissance du vivant. Epistémologie de l'évolution: Evolutionnisme versus créationnisme. Connaissance scientifique et connaissance philosophique du vivant.

II - LISTE DES PRINCIPALES PUBLICATIONS

Ne figurent ici que les publications en Histoire et philosophie des sciences depuis 2005 (pour les publications antérieures, en particulier en philosophie politique, s'adresser à l'auteur):

1 - Concepts d’individualité biologique et d’association, histoire et modèles de la symbiose et du mutualisme :

· 2005, « L’individuation chez Gilbert Simondon », Bulletin d’Histoire et d’Epistémologie des Sciences de la Vie, XII, 1, pp. 159-172.

· 2005, « L’acquis dans l’histoire des recherches sur la symbiose, la bioluminescence », in MC Maurel, B. Brun (dir.), L’inné et l’acquis, nouvelles approches épistémologiques, PUP, Aix en Provence, pp. 77-90.

· 2006, « Symbiose à Zoochlorelles et développement, le modèle Paramecium bursaria, 1900-1940 », Actes du congrès d’histoire des sciences et des techniques - Poitiers 2004, Cahiers d’histoire et de philosophie des sciences, SFHST, pp.153-162.

· 2006, « Aux origines des recherches sur la symbiose, vers 1868-1883 », Revue d’Histoire des Sciences, 59, 1, pp. 5-27.

· 2006, « La symbiose chez les insectes : Umberto Pierantoni identifie les mycétomes de plusieurs espèces d’Homoptères », Bulletin d’Histoire et d’épistémologie des Sciences de la vie, XIII, 2, pp. 169-194.

· 2007, « Les insectes et leurs endosymbiotes, leur découverte de Blochmann à Buchner (1880-1930) – Première partie », Bulletin de la Société linnéenne de Lyon, 76 (1), pp. 11-18.

· 2007, « Les insectes et leurs endosymbiotes, leur découverte de Blochmann à Buchner (1880-1930) – Deuxième partie », Bulletin de la Société linnéenne de Lyon, 76 (2), pp. 27-37.

· 2007, De la société à la symbiose, 1930-1970, Une histoire des découvertes sur les associations dans le monde vivant, vol. 2, Vrin, 437 pp.

· 2008, Embryologie et évolution (1880-1950), Histoire générale et figures lyonnaises, Ed. Olivier Perru et Michel Morange, Vrin, Paris, 179 pp.

· 2008, « Symbiose et classification chez les insectes, l’école de Buchner (1886-1978) », Peut-on classer le vivant ? Linné et la systématique aujourd’hui, Belin, Paris, 2008, pp. 81-89.

· 2011, « Le mutualisme biologique, concepts et modèles », History and philosophy of the life sciences, 33 (2011), pp. 223-248.

· 2011, « Coûts et bénéfices dans les modèles mutualistes: le problème épistémologique des marchés biologiques », Ludus vitalis, XIX, 36, 2011, pp. 85-112.

2 - Epistémologie des Sciences du vivant. Questions historiques et épistémologiques  diverses.

· 2005, Le Vivant, approches pour aujourd’hui, Cerf, Paris.

· 2005, « La dimension historique du savoir », Editorial, Revue de l’Université catholique de Lyon, 7, pp. 5-6.

· 2005, « Savoirs et histoire, questions autour de l’histoire des sciences : Canguilhem et Lakatos », Revue de l’Université catholique de Lyon, 7, pp. 30-35.

· 2005, « Science et non-science », Revue philosophique de Louvain, 103, 3, pp. 415-425.

· 2005, « Le rêve, introduction philosophique », Revue de l’Université catholique de Lyon, 8, pp. 9-11.

· 2006, « L’homme et le vivant », Esprit et Vie, 150, pp. 11-15.

· 2006, « Cooperation strategies, Signals and Symbiosis », Comptes-rendus de l’Académie des Sciences, Biologies, 329, 12 (2006), pp. 928-937.

· 2007, « Réseaux et genèse de la forme : perspectives épistémologiques », Internationale Zeitschrift für Geschichte und Ethik der Naturwissenschaften, 15, pp. 161-178.

· 2007, « Bergson, la conscience et la vie », Esprit et Vie, 173, pp. 1-8.

· 2007, « Le tout et les parties, une philosophie des réseaux d’interaction en biologie », Théophilyon, XIII, 2, pp. 307-325.

· 2008, « De l’animal à l’homme, existe-t-il encore une différence spécifique », Intelligence animale, Intelligence humaine, Ed. M. Delsol, B. Feltz, M.-C. Groessens, Vrin, Paris 2008, pp. 117-130.

· 2009, Science et itinéraire de vie : la pensée de Bergson, Kimé, Paris.

· 2010, La création sans le créationnisme ?, Kimé, Paris.

· 2011, "Le vitalisme bergsonien dans l'évolution créatrice", Repenser le vitalisme, PUF, pp. 167-179.

· 2011, "La réception des idées de Darwin en France et le problème du fixisme", Evolution et création: des sciences à la métaphysique, Vrin, Paris.

Articles divers: 

· 2008, « Réflexions sur recherche scientifique et religion », Revue de l’Université catholique de Lyon, 13, pp. 17-22.

· 2008, « Peirce Charles Sanders, Ecrits logiques », Œuvres III, Cerf, Paris, 2006, Comptes rendus, Philosophiques, 35, 2, pp. 620-626.

· 2010, "Chimères et paradoxes", Revue d'éthique et de théologie morale, 258, pp. 132-136.

· 2010, "Hellénisme, Islam et pensée occidentale", Esprit et Vie, 228, pp. 31-36.

· 2011, "Ouvrir le temps de l'apologétique: Science naturelle et existence de Dieu chez Fénelon", Revue des sciences philosophiques et théologiques, 2011, 4, pp. 813-833.

Livre en projet :

- De la société à la symbiose, 1970-2000, Une histoire des découvertes sur les associations dans le monde vivant, vol. 3.

Livre en cours de poblication :

- Hommes d'Eglise et Sciences au XVIIIe siècle: vers une harmonie entre Raison, Nature et Création?.

Exemples de livres et revues publiés :

III- ACTIVITÉS D’ENSEIGNEMENT ET D’ADMINISTRATION:

• Responsable mention master HPDS et responsable spécialité Master Recherche en Construction, communication, appropriation des savoirs scientifiques et techniques.

• UE transversales licence, Université Lyon1, Peut-on se passer de l'évolution et Questions autour du vivant. Co-responsabilité des UE transversales SHS licence.

• UE, niveaux 1 et 2, Master1 HPDS, Université Lyon 1, Introduction à l’histoire et à la philosophie des Sciences, Responsable d’UE.

• Interventions de Philosophie des Sciences, UE TC en Histoire et Philosophie des Sciences, Master2 HPDS. Responsable de l’UE Epistémologie de la biologie et de la complexité (UE de M2 HPDS, Lyon 1, Montpellier 2). Interventions en histoire et philosophie des sciences du vivant dans les autres UE de M2 HPDS.

• Cours en Faculté de Médecine (PACES, Culture générale et certificat optionnel de philosophie du vivant), Université Lyon 1. Cours d'histoire des sciences de la vie dans le M1 enseignement de SVT.

• Enseignements de philosophie à l’extérieur (Faculté de philosophie, Université catholique de Lyon). Jury d’examens à l’IFCS du Vinatier depuis 2001.

IV - ACTIVITÉS DE RECHERCHE, ENCADREMENT DOCTORAL, DIFFUSION DES SAVOIRS :

1 - Colloques, conférences, séminaires.

- Colloques de 2005 à 2010 :

- Stratégies de coopération, signaux et symbiose, Société française de biologie théorique, Saint-Flour, 13-15 juin 2005.

- La symbiose chez les insectes : Umberto Pierantoni identifie les mycétomes de plusieurs espèces d’Homoptères, Communication au colloque SHESVIE de mars 2006, Paris.

- Symbiose et modélisation en biologie, un point de vue épistémologique, Conférence francophone sur la modélisation en biologie et en médecine, Craiova, Roumanie, 2006.

- Participation au colloque Bachelard et Bergson, 28-29 septembre 2006, Université Lyon3. Intervention sur Le concept d’individualité chez Bergson et Canguilhem.

- Symbiose et classification, l’école de Buchner, Communication au colloque « Faut-il classer le vivant ? », Dijon, 31-01 au 02-02-2007.

- Buffon, sa description des sociétés animales et humaines, Communication au colloque « Les Lumières », Montpellier, 10 et 11 juillet 2007.

- L’usage du signe en histoire naturelle au 18^ème siècle et la Logique de Port-royal, Communication au colloque « Les Lumières », Montpellier, 10 et 11 juillet 2007.

- Bergson entre création et évolution, communication au colloque de la SHESVIE, Poitiers, 13 mars 2008.

- La Logique de Port-Royal et l’usage du signe au service de la connaissance, Colloque « Figures de la raison dans les sciences contemporaines et en théologie », Lyon, 16 et 17 mai 2008.

- Epistémologie et valeurs : actualiser la démarche de Bergson pour faire croître l’être humain, Mondialisation et éducation : Vers une société de la connaissance, 15^ème congrès international de Sciences de l’Education (AMSE), Université Cadi Ayyad, Marrakech, Maroc, 2 – 6 juin 2008.

- Les biologistes parisiens dans L’évolution créatrice d’Henri Bergson, Troisième congrès de la Société française d’histoire des sciences et des techniques (SFHST), Paris, 4 – 6 septembre 2008.

- Armand de Quatrefages, un fixiste modéré lecteur de Darwin, Communication au congrès annuel de la SHESVIE, Paris, 27 mars 2009.

- Le vitalisme bergsonien dans L’évolution créatrice, Communication au Colloque International Vie, Vivant, Vital : Vitalisme, Montpellier, 24 au 27 juin 2009.

- La réception du transformisme dans les milieux catholiques à la fin du XIXè siècle, Congrès international d’histoire des Sciences, 27 juillet – 2 août 2009, Budapest.

- Le mutualisme biologique, une histoire des premiers modèles mathématiques, Congrès annuel de la SHESVIE, Université de Strasbourg, 26 mars 2010.

- La réception des idées de Darwin en France et le problème du fixisme, Colloque "Perspectives sur l'évolution et la création, entre savoir et spéculation", Université catholique de Lyon, 10-11 juin 2010.

- Le mutualisme biologique, concepts et modèles, colloque de la SFHST, Nantes, 18-20 mai 2011.

- Modélisations récentes du mutualisme biologique (depuis 1980), Communication au congrès annuel de la SHESVIE, Angers, 18 mars 2011.

- Apprendre à bien juger et à raisonner, former des enseigants au XVIIIe siècle: les manuscrits du Frere Paschal, Communication au XIIIe Congrès international des études du XVIIIe siècle, Graz, 28 juillet 2011.

- Conférences et journées d’études :

            - Journée d’étude REHSEIS, 17 déc. 05, Paris.

- S’associer pour travailler, coopérer, Conférence donnée aux Facultés catholiques de Lyon, 21 novembre 2005.

- Matière et mémoire, Bergson et les Neurosciences, Conférence donnée aux Facultés catholiques de Lyon en Mai 2006.

- Conférence Qu’est-ce aujourd’hui qu’une espèce ?, à l’Institut catholique de Paris, le 24 mai 2007.

- Communication Symbiose et modélisation contemporaine en biologie, Projet Evo-Eco, ANR, IHPST, 11 février 2009.

- Conférence De l’animal à l’homme, Séminaire Master1, Université catholique de Lyon, le 9 mars 2009.

- Conférence Création et Evolution au séminaire « Enseigner l’évolution » (groupe E2, INRP), 18 mars 2009.

- Conférence Histoire de la symbiose, ISEFC, Université de Tunis, le 22 janvier 2010.

- Conférence Peut-on se passer de l'évolution?, ISEFC, Université de Tunis, le 22 janvier 2010.

- Conférence L'homme et le progrès scientifique, 16 mars 2011, Université ouverte, U. Lyon 1.

- Conférence L'émergence de la conscience,  11 avril 2011, Université ouverte, U. Lyon 1.

- Conférence Bergson et la science, espace et temps, 30 novembre 2011, Université ouverte, U. Lyon 1 et UNIVA, UCLy.

- Conférence L'influence des philosophes sur l'orientation et le développement des sciences: le cas Malebranche (1638-1715), 6 janvier 2012, Université ouverte, U. Lyon 1.

- Conférence Le choc de l'évolution au XIXe siècle, vers une nouvelle lecture de la création?, cycle "Quand les religions doutent de la science", 12 et 13 mars 2012, UCL, Louvain la Neuve et Bruxelles, Belgique.

- Conférence Une philosophie de la nature et du vivant est-elle encore possible?, 14 mars 2012, Université ouverte, U. Lyon 1 et UNIVA, UCLy.

- Conférence Bachelard entre science et symbolique, l'imagination de la matière, 6 avril 2012, Université ouverte, U. Lyon 1.

- Conférence L'homme, les progrès scientifique et la relativité des mondes, 2 mai 2012, Université ouverte, U. Lyon 1 et UNIVA, UCLy.

- Séminaires, Colloques, congrès :

- Organisation et réalisation du colloque Histoire de l’embryologie et évolution, 1880-1950, Université Lyon 3, mars 2007 et du congrès de la SHESVIE, les 23 et 24 mars 2007.

- Organisation du séminaire interne au LEPS-LIRDHIST sur L’activité de modélisation en 2008 et 2009.

- Organisation du séminaire étudiant de la deuxième année de master recherche HPDS depuis 2007.

- Contribution à l’organisation des congrès annuels de la SHESVIE depuis 2008.

- Diffusion des savoirs, Exemples :

- Contribution à la préparation de l’exposition au jardin botanique du parc de la Tête d’Or. Explorer et classer : la quête scientifique. Date de l'évènement : Du 2 octobre 2007 au 16 janvier 2008. Réalisation d’un panneau sur Les sociétés animales chez Buffon.

- Communication Les divers aspects de la connaissance du vivant et participation au débat Sciences et croyances, Université Lyon 1, le 14 décembre 2007.

- Intervention sur l’intérêt de l’histoire des sciences à la Semaine des sciences du Lycée La Martinière-Montplaisir (Lyon) en février 2008.

- Participation à la conférence-spectacle « Seuls dans l’univers ? » au Centre Charlie Chaplin à Vaulx en Velin, le 25 février 2009, sur le thème « La vie évolue-t-elle vers l’intelligence ? ». Intervention relatée dans "Seuls dans l'Univers?", (Gilles Adam, André Brack, Alain Brémond, Juliette Brémond, Georges Paturel, Olivier Perru), Collectif jets d'encre, Presses de l'IML.

2 - Responsabilités institutionnelles diverses et projets de recherche:

- Conseil d’administration et Trésorier de la SHESVIE (Société d’Histoire et d’Epistémologie des Sciences de la vie).

- Activités ponctuelles d’expertise (projets de recherche, publications).

- Commissions de spécialistes, Ecole centrale de Lyon et Université Lyon 1, 2007-2008.

- Nommé en section 72, CNU, Conseil national des Universités (Novembre 2007) pour 2007-2011.

- Coordinateur Comité consultatif, section 70 à 73, Université Lyon 1, 2008-2012. Président du comité de sélection, sections 20-72, recrutement MC à l’Université Lyon 1, mai-juin 2009. Président du comité de sélection, section 22, recrutement MC a l'IUFM - Université Lyon 1, mai-juin 2010. Comité de sélection, sections 70-72, recrutement MC, Université Lyon 1-INRP, mai 2010. Comité de sélection, section 72, recrutement MC, U. Bordeaux 1, 2011.

- Participation au Projet ANR Evo – Eco, retenu en juillet 2008 (2009-2011). Titre du projet : Théorie de l’évolution biologique et théorie économique: modalités, fondements et perspectives d’une relation à double sens

- Président du jury rectoral, masters enseignement, Université catholique de Lyon, depuis 2010.

- Elu suppléant en section 72, CNU, (Octobre 2011) pour 2011-2015.

3 - Encadrement. 

Directions de mémoires de master :

Léo Coutellec, 2007, Histoire des fondements du concept de commensalisme en biologie au 19ème siècle, Master HPDS, université Lyon 1.

Mathieu Chevallet, 2007, De la découverte de l’ADN chloroplastique à la théorie de l’évolution, Master HPDS, Université Lyon 1.

Sophie Biétrix, 2008, Le concept de gène employé par les spécialistes a-t-il une influence sur leur approche des OGM ?, Master HPDS, Université Montpellier 2.

Guillaume Imbert, 2008, Individualité et durée chez Bergson, (Master philosophie, Université    catholique de Lyon). 

Pascale Rebaudet, 2008, La reconnaissance de la personne dans la maladie  d’Alzheimer, (Master philosophie, Université catholique de Lyon). 

Brice Poreau, 2010, La pensée biologique du milieu du XIXème siècle au milieu du XXème siècle, dans la philosophie de Gilbert Simondon, Master HPDS, Université Lyon 1.

Danièle Vial, 2011, Histoire de la prise en compte des caractères des os de la mâchoire dans la classification des Téléostéens, Master HPDS, Université Lyon 1.

Moncef Berhouma, 2011, L'allégorie du Kônarion: une histoire de la glande pinéale de Galien à Descartes, Master HPDS, Université Lyon 1.

Jean-Pierre Dramisino, 2011, Une conception unifiée de l'homme: un enjeu de l'interdisciplinarité SVT-Philosophie, Master HPDS, Université Lyon 1.

Alex Léna, 2011, Actualisme, connaissance commune ou connaissance scientifique, nature d’un paradigme, Master HPDS, Université Lyon 1.

Direction ou co-Direction de Thèses soutenues à l'Université Lyon1:

Alaya Alaya, L’éducation à l’environnement en Tunisie. Analyse des valeurs relatives à la nature et à l’environnement dans les conceptions d’enseignants et d’élèves et dans des manuels scolaires, (cotutelle ISEFC, Université de Tunis), thèse soutenue le 23 janvier 2010 à Tunis. (co-encadrement 0,5)

(Pour mémoire, à l’Université catholique de Lyon, Guy Ferréol, juin 2009, La distinction et l’articulation  du sens dans l’activité scientifique).

Simon Gouz, septembre 2010, Biographie d'une vision du monde: Les relations entre science, philosophie et politique dans la conception marxiste de J. B. S. Haldane.

Gérald Fournier, novembre 2010, Evolution et civilisation: report des pressions sélectives, émancipation et technosymbiose. De l'anthropologie de charles Darwin à l'économie évolutionniste étendue.

Assaad Yammine, septembre 2011, L’éducation à la sexualité humaine au Liban: avancées et difficultés (en collaboration, didactique de la biologie ; cotutelle Université libanaise).

Sami Abdelli, juillet 2011, Reproduction humaine et éducation à la sexualité en Tunisie et en d’autres pays euro-méditerranéens : Analyse comparative des curricula, de documents scientifiques et des conceptions d’enseignants (cotutelle Université de Tunis).

Thèses dirigées à l'Université Lyon 1:

Brice Poreau, Genèse de l'écologie et de ses modèles; Histoire et modèles du mutualisme et du commensalisme (intitulé provisoire).

Alex Léna, Le raisonnement circulaire et l'actualisme en Géologie (intitulé provisoire).

Nombreuses participations a des jurys de thèse, comme rapporteur ou président de jury.